फूलों की खेती के लिए प्रयुक्त मिट्टी की समग्र संरचना अच्छी होनी चाहिए, उपजाऊ होनी चाहिए, जल निकास अच्छा होना चाहिए तथा उसका pH उचित होना चाहिए। फूलों की खेती में, जड़ों की वृद्धि को सुविधाजनक बनाने के लिए, कमजोर जड़ प्रणाली वाली प्रजातियों, बल्बनुमा पौधों और फूलों के पौधों के लिए अक्सर रेतीली दोमट मिट्टी का उपयोग किया जाता है। बहुत अधिक रेतीली मिट्टी उर्वरक और नमी को बनाए रखने के लिए अनुकूल नहीं होती है, और इसे चिकनी मिट्टी या ह्यूमस मिट्टी के साथ मिलाया जा सकता है; अत्यधिक चिपचिपी मिट्टी में जल निकासी की खराब व्यवस्था होती है, जो अक्सर हवा की कमी और जड़ सड़न का कारण बनती है, विशेष रूप से बल्बों और बारहमासी फूलों के लिए, जिनमें जलभराव नहीं होना चाहिए और नदी की रेत या मोटे भूसे की राख डालकर इसमें सुधार किया जा सकता है।

बहुत अधिक अम्लीय या बहुत अधिक क्षारीय मिट्टी फूलों की वृद्धि के लिए अनुकूल नहीं होती है। अधिकांश खुले मैदान के फूलों को लगभग तटस्थ मिट्टी (पीएच 7 के आसपास) की आवश्यकता होती है, जबकि ग्रीनहाउस के फूलों को अम्लीय या थोड़ी अम्लीय मिट्टी (पीएच 7 से कम) पसंद होती है। कुछ प्रजातियों को उच्च अम्लता वाली मिट्टी की आवश्यकता होती है, जैसे कि एज़ेलिया और कैमेलिया, जिन्हें 4-5 के पीएच मान वाली मिट्टी की आवश्यकता होती है। ये फूल क्षारीय या तटस्थ मिट्टी में पीले हो जाएंगे। मिट्टी की अम्लता बढ़ाने के लिए आप उचित मात्रा में फेरस सल्फेट (काली फिटकरी) डाल सकते हैं। इसके विपरीत, यदि मिट्टी बहुत अधिक अम्लीय है, तो आप इसे बेअसर करने के लिए उचित मात्रा में चूना या लकड़ी की राख मिला सकते हैं।

मिट्टी में अक्सर विभिन्न रोगाणु मौजूद होते हैं, इसलिए फूल लगाने से पहले इसे कीटाणुरहित करना आवश्यक है। सबसे सरल कीटाणुशोधन विधि यह है कि सीमेंट के फर्श पर मिट्टी फैला दी जाए और गर्मी के दिनों में उसे 3-5 दिनों के लिए धूप में रखा जाए, तथा बार-बार पलटा जाए। छोटी मात्रा को दवा या भाप से रोगाणुमुक्त किया जा सकता है।

हाल के वर्षों में, फूलों में मिट्टी रहित खेती भी अपनाई जाने लगी है, जैसे कि हाइड्रोपोनिक्स, सैंड कल्चर, ग्रेवल कल्चर, स्प्रे हाइड्रोपोनिक्स और एरोपोनिक्स। पौध-रोपण के लिए आमतौर पर प्रयुक्त की जाने वाली कटिंगों में गुलाब, चमेली और गार्डेनिया के लिए रेत और बजरी की कल्चर, तथा डैफोडिल्स, सदाबहार और ग्लास जेड के लिए इनडोर हाइड्रोपोनिक्स शामिल हैं। यद्यपि मृदा रहित खेती के लिए बड़े निवेश की आवश्यकता होती है, लेकिन इसकी उपज अधिक होती है, मृदा खेती प्रबंधन पर बचत होती है, बीमारियों और कीटों की घटना कम होती है, यह पुष्प उत्पादन के औद्योगिकीकरण के लिए अनुकूल है, तथा इसमें विकास की बहुत संभावनाएं हैं।